Het verhaal begint als papa en mama Raes (Jaak Van Assche en Marilou Mermans, beiden bekend van Alfa Papa Tango) hun zoon Sammy (Sven De Ridder) naar de studentenstad brengen. Hij deelt zijn kamer met Tom Smits (Tom Van Landuyt) en Dennis Verwey (Mathias Sercu).
Al spoedig maken de eerstejaars Economie kennis met Cuniculus, de studentenclub met als praeses Guy Bogaerts (Tom Van Bauwel) die wordt bijgestaan door zijn vriendinnetje Lisa (Tania Poppe). Hij legt met veel lef uit dat de traditie wil dat de 'schachten' worden gedoopt. Dit gebeurt in twee stappen. Eerst is er de schachtenverkoop, waarbij de anciens eerstejaars kunnen kopen in ruil voor een paar glazen bier. Men mag dan individueel een opdracht aan de schacht opgeven. Later volgt dan een groepsdoop.
Sammy denkt er in eerste instantie niet aan om mee te doen aan deze vaak wansmakelijke toestanden. Zijn kamergenoten kunnen hem echter overtuigen en voor hij er erg in heeft, staat hij op het podium om verkocht te worden. Niemand van de studenten heeft interesse in Sammy, en de praeses verzint dan maar zelf een opdracht.
Even later wordt Tom aan de Nederlandse studente Petra Dercks (Margot Van Doorn) vastgeketend en verkocht aan de twee Pieten (Jan Bijvoet en Victor Zaidi). Beide slachtoffers brengen hun opdracht tot een goed einde, maar de praeses komt een kijkje nemen en is niet tevreden. Hij verzint een nieuwe opdracht. Tom moet de muur van het het stadhuis opklimmen. Hij weigert echter en Guy voelt zich beledigd en vertrekt.
Onder druk van Lisa zal hij er voor zorgen dat de doop van dit jaar nog beter wordt dan andere jaren. De twee Pieten herinneren hem aan het ongeluk dat een aantal jaren geleden is gebeurd met het 'vliegende tapijt', maar daar heeft de praeses geen oren naar.
Wanneer later bij de groepsdoop blijkt dat Sammy de opdracht van Guy Boogaerts niet heeft uitgevoerd, wordt hij aan het vliegende tapijt onderworpen. Men slingert de inmiddels dronken gevoerde Sammy een paar keer in de lucht met een laken, en trekt het dan plotseling weg. Onder de ogen van zijn kamergenoten komt Sammy met een smak op de grond terecht.
Tom en Petra (die inmiddels op elkaar verliefd zijn geworden) proberen de politie ervan te overtuigen dat het geen ongeluk, maar moord was. De vader van Guy (Herbert Flack) heeft echter een lange arm, en slaagt er in zijn zoon te beschermen. Schoeters (Senne Rouffaer), de rector van de universiteit, wil niet naar het verhaal luisteren en beschuldigt het tweetal ervan de universiteit door het slijk te sleuren. Het komt tot een rechtzaak, die wegens gebrek aan bewijs wordt verloren. In Sammy's bloed werd 2,2 promille alcohol aangetroffen, en de meerderheid van de aanwezigen was te dronken om zich nog iets van de avond te herinneren.
De wraak van Tom en Petra is zoet. Het tweetal zorgt ervoor dat Guy alsnog gestraft wordt. Tot zover het verhaal.
Het studentenmilieu wordt in Ad Fundum wel erg pervers en onsmakelijk voorgesteld, waarbij het duo Guy/Lisa soms zelfs naar het sado-masochistische toe dreigt te gaan. Het is dan ook niet verwonderlijk dat regisseur Erik Van Looy (zelf een geheelonthouder) en producer/scenarist Marc Punt, met deze film de woede van heel wat studentenclubs op zich gehaald hebben.
De aggresieve sfeer die gecreeerd wordt, draagt echter bij tot de algemene sfeer van de film. Bovendien schijnen heel wat mensen te vergeten dat dit een fictief verhaal is, waarin de werkelijkheid over het algemeen ver te zoeken is.
Toch dreigt Ad Fundum op bepaalde momenten in elkaar te storten. Het ogenblik waarop Tom Van Landuyt en Margot Van Doorn uit de kleren gaan bijvoorbeeld, is ongepast en verstoort het ritme van de film. Verder is het wel erg makkelijk om humor in de film te brengen door een paar Nederlanders (met Joop op kop) in het verhaal te schrijven.
Van de rest van de acteurs overigens geen slecht woord. Sven De Ridder speelt zijn rol als onschuldige eerstejaars perfect, en samen met Van Landuyt toont hij dat ze ook het serieuze werk aankunnen. Naast de nieuwkomers op filmgebied (Margot Van Doorn en Tanja Poppe bijvoorbeeld), herkent u ook een aantal akteurs en aktrices uit Wittekerke en De Collega's.
Tot slot is er nog de filmmuziek, gebracht door Tom Wolf, Frankie Miller, Tom Van Landuyt en Sam Brown, die maakt dat Ad Fundum een studentendrama is dat mag gezien worden.