Een opgeklommen gynaecoloog (De Vito) en Dr. Hess (Schwarzenegger) proberen een nieuw middel tegen onvruchtbaarheid, Expectane, op de markt te brengen. Dat is echter buiten de FDA (een commissie voor volksgezondheid) gerekend. Deze geven immers geen toestemming om het middel op mensen uit te testen. Hoewel ze plots hun financiële steun en laboratorium verliezen, geven de twee wetenschappers de moed niet op.
Na wat tegenstrubbelen laat Dr. Hess zich overhalen om het middel in het geheim op zichzelf uit te testen. Een bevrucht eitje wordt in zijn buikwand ingeplant en naast Expectane krijgt hij ook de nodige vrouwelijke hormonen. Oorspronkelijk lijkt er niets fout te lopen, tot blijkt dat de vrucht zich niet alleen goed ontwikkeld, maar dat Dr. Hess bijzonder vrouwelijke manieren verworven heeft.
Alsof het nog niet gecompliceerd genoeg is, besluit Hess na één trimester het kindje niet op te geven, maar om buiten medeweten van zijn collega Expectane verder in te nemen en de volledige zwangerschap te doorlopen. Zijn opbollend buikje is echter moeilijk te verbergen en als de nieuwsgierige onderzoekster Diane (Emma Thompson) zich er ook nog eens mee komt bemoeien, is het hek natuurlijk van de dam.
Vooral nadat Cupido zijn pijlen afschiet op Hess en Diane, en er dus de nodige romantiek in de lucht hangt, is er chaos alom. Al vlug komt de film in een humoristische stroomversnelling terecht. Zo kun je Schwarzenegger in de laatste dagen van zijn zwangerschap bewonderen tussen andere hoogzwangere dames, terwijl ze de nodige kennis opdoen omtrent babyverzorging en zwangerschapsoefeningen.
De film kent een bijzonder ontroerend happy-end. Wat is er dan ook tederder of zachter dan een geboorte, het begin van een nieuw leven. Hoe roerend het einde dan ook is, Reitman slaagt er in ook hier weer een grappige noot toe te voegen.
Wie zin heeft in een intellectueel hoogstaande film, kan Junior beter links laten liggen. Maar wie wil er eens niet genieten van de hilarische toestanden die (blijkbaar altijd) onstaan bij het omdraaien van de traditionele rolverderling? En als dat dan nog gebeurd met acteurs als Schwarzenegger en Thompson, dan kan wat ons betreft de avond niet meer stuk.